Actualmente las visitas a la cueva original siguen estando muy restringidas, pero gracias a la tecnología se puede contemplar en toda su magnitud el arte del hombre que habitó aquellos parajes en la réplica situada en el Museo de Altamira. El complejo museístico de Altamira, que comprende la Neocueva, el Museo y el centro de investigación, está considerado como el centro europeo más importante en la divulgación prehistórica. Junto a este Complejo, se halla la cueva de Altamira, cuyo arte aparece disperso en toda su longitud, de más de 300 metros, aunque se pueden distinguir varias zonas en forma de salas, en las que los artistas paleolíticos realizaron sus representaciones pictóricas.

Las más conocidas y representativas de Altamira: las pinturas del Gran Techo, más de 30 figuras de bisontes, caballos y ciervos, que destacan por su tamaño y por la calidad de su ejecución. Las figuras están representadas en el techo y pintadas con ocre natural de color rojizo y silueteadas con líneas negras de carbón vegetal. En las figuras de los bisontes son admirables las posturas -encogidos, saltando o simplemente de pie- que demuestran la gran capacidad de expresión pictórica del hombre paleolítico. La cueva tiene a lo largo de su extensión otras pinturas y grabados más aislados, fundamentalmente, en su parte más profunda.

Desde su inauguración en julio de 2001, el Museo Altamira situado junto a la cueva de Altamira, se ha convertido en uno de los referentes artísticos y turísticos más importantes de Cantabria. El Museo, integrado dentro de la red de Museos Nacionales, fue diseñado por Navarro Baldeweg y en el se encuentra una exposición permanente “Los tiempos de Altamira” que en sus diferentes secciones se adentra en la Prehistoria peninsular. Además, este museo cuenta con una reproducción fidedigna de la cueva de Altamira, una cuidada reconstrucción ambiental que recrea el entorno de la Cueva durante el Paleolítico Superior y que constituye un elemento didáctico y lúdico de gran importancia.

Además, y como parte de la actividad del museo, se programan distintos talleres sobre la prehistoria y sus formas de vida, se trata de actividades muy didácticas dirigidas a los más pequeños en los que les enseñan algunas de las técnicas básicas.

En el Zoo de Santillana hay más de 2.000 animales, todos ellos en recintos especialmente diseñados para que las especies que los habitan puedan vivir en perfectas condiciones.

El Zoo de Santillana está concebido como un bello recinto lleno de árboles y plantas con carteles explicativos en sus caminos, en los que pasear contemplando las diferentes variedades de flora se convierte en la actividad complementaria a la visita. Uno de los parques temáticos más atractivos de este Zoo es el Jardín de las Mariposas.

Otro de los parques temáticos es el Parque del Cuaternario, una réplica actual de las especies que poblaban este lugar en la época de los habitantes de Altamira. Esta zona alberga la fauna, que con toda probabilidad, vivió en esta misma zona hace 14.000 años y que fue representada por el hombre de Altamira en su arte rupestre de las cuevas de Altamira. Los animales integrados dentro de este nuevo recinto son: Bisontes europeos, Caballos de Przewalski, Ciervos y Jabalíes (ya inmortalizados por el artista en Altamira), así como Renos, Linces boreales, Corzos, Nutrias, Osos, Lobos y Ardillas (algunos de los cuales aparecen dibujados en cuevas prehistóricas de la época ó restos suyos han sido hallados en excavaciones, y otros de ellos presumiblemente habitaron este mismo lugar en aquel período).

La Fundación Santillana es una entidad privada destinada al fomento de la educación, la investigación científica y la difusión de la cultura. Constituida en 1979 y presidida por don Jesús de Polanco, desarrolla sus iniciativas en un amplio marco de cooperación, tanto en el ámbito nacional como internacional, en especial con Iberoamérica.

La Fundación tiene como sede histórica la Torre de don Borja, donde se celebran exposiciones sobre temas históricos, artísticos y antropológicos, en su mayor parte vinculadas a los países Iberoamericanos.

Ubicado en la Plaza del Abad Francisco Navarro, junto a la Colegiata de la Villa, y como fruto de la voluntad del artista de donar toda su obra a la villa, con la finalidad de poder ser admirada públicamente, es museo recoge la obra del escultor Jesús Otero, natural de Santillana del Mar. En 1994 se creó el Museo y la Fundación "Jesús Otero", de propiedad municipal regido por un patronato formado por representantes del Ayuntamiento, de instituciones culturales de la villa, la Universidad de Cantabria y Universidad Internacional Menéndez Pelayo y familiares del artista. Está presidido por el Alcalde.

Se encuentra ubicado en el edificio del antiguo convento de frailes dominicos, bajo la advocación de "Regina Coeli" (la Reina del Cielo). Creado a finales de los años 60, su finalidad es conservar, estudiar y exponer el patrimonio artístico religiosos de la Diócesis.

Contiene más 8OO obras procedentes de gran parte de las parroquias de la región. Una de las principales características de este Museo es el aspecto popular de sus obras. Se observa un gran predominio de la escultura que junto con la cantería ha sido el oficio tradicional por excelencia en nuestra región.

Un gran conjunto patrimonial integrado por un palacio de finales del siglo XVII, el Palacio de Benemejís, de tradición tardobarroca, al que acompañan dos edificios de tradición gótica, todos ellos enmarcados por un jardín botánico histórico de 75.000 m2 de gran belleza.

Este palacio, desde 1993, se ha convertido en un centro cultural multiusos con tres salas de exposiciones, una de reuniones y un salón de conferencias.

Es la sede permanente de la colección de arte de Caja Cantabria y alberga proyectos expositivos de relevancia.

Estas dos edificaciones, cuya titularidad corresponde al Gobierno de Cantabria, forman un conjunto arquitectónico situado en la zona alta de la plaza Mayor, también llamada plaza del Mercado. La construcción corresponde al siglo XVI, la Casa de la Parra, y al siglo XVII, la Casa del Águila. Ambas acogen exposiciones temporales organizadas por la Consejería de Cultura, Turismo y Deportes del Gobierno de Cantabria.